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1.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; YAMAGISHI, M. E. B. gene_name_to_refseq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.

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2.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.

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3.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION: um software paralelizado para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em escala genômica. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 163-166.

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4.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION. Versão 1.0.1. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.

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5.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.

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6.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.

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7.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.

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8.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. de; CINTRA, L.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 177. X-meeting 2015.

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9.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, p. 1-16, Aug. 2015.

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1.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; YAMAGISHI, M. E. B. gene_name_to_refseq. Versão 1.0. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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2.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 7., 2011, Campinas. Resumos... Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2011. p. 28-31.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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3.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION: um software paralelizado para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em escala genômica. In: MOSTRA DE ESTAGIÁRIOS E BOLSISTAS DA EMBRAPA INFORMÁTICA AGROPECUÁRIA, 8., 2012, Campinas. Resumos... Brasília, DF: Embrapa, 2012. p. 163-166.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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4.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; LOBO, F. P. POTION. Versão 1.0.1. Campinas: Embrapa Informática Agropecuária, 2014. 1 CD-ROM.
Tipo: Software
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5.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 6., 2012, Jaguariúna. Anais... Jaguariúna: Embrapa; ITAL, 2012. p. 1-10. CIIC 2012. No 12612.
Tipo: Artigo em Anais de Congresso
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6.Imagem marcado/desmarcadoCINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Development of a computational pipeline to detect positive selection. In: INTERNATIONAL PLANT & ANIMAL GENOME, 20., 2012, San Diego. Abstracts... Jersey City: Scherago International, 2012. 1 pôster. PAG 2012. P1007.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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7.Imagem marcado/desmarcadoCASTRO, G. M. de; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. Positive selection in homologous genes of Alphaherpesviruses. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE BRAZILIAN ASSOCIATION FOR BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 8., 2012, Campinas. Abstract book... Ribeirão Preto: AB3C, 2012. Não paginado. X-MEETING 2012.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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8.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. de; CINTRA, L.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. In: INTERNATIONAL CONFERENCE OF THE AB3C, 11.; BRAZILIAN SYMPOSIUM OF BIOINFORMATICS, 2015, São Paulo. Proceedings... [S.l.]: AB3C, 2015. p. 177. X-meeting 2015.
Tipo: Resumo em Anais de Congresso
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9.Imagem marcado/desmarcadoHONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. BMC Genomics, London, v. 16, p. 1-16, Aug. 2015.
Tipo: Artigo em Periódico IndexadoCirculação/Nível: A - 1
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